הסדרה עוקבת אחר אליוט, מתכנת צעיר אשר סובל מחרדה חברתית ודיכאון. אליוט עובד כמהנדס אבטחת סייבר ביום, אך בלילות הוא האקר פורע חוק. הוא מוצא את עצמו בצומת דרכים כאשר מנהיג מסתורי של קבוצת האקרים מחתרתית בשם "מיסטר רובוט" מגייס אותו כדי להרוס את התאגיד שמשלמים לו כדי להגן עליו.