תקציר הסרט "האויב בתוכנו - סטארטרק (תלת מימד)"לאחר שנקרא חזרה הביתה, מגלה צוות האנטרפרייז כוח בלתי ניתן לעצירה שתקף את צי הכוכבים והשאיר את כדור הארץ במשבר. על קפטן קירק והצוות מוטלת משימה: להוביל את המצוד הקטלני ללכידת הגורמים האחראים ולהשליט סדר חדש.